信工学院教师余振华研究成果被生物信息学顶级期刊Bioinformatics收录

发布日期:2019-09-23    浏览次数:

【宁夏大学新闻中心讯 信息工程学院】近日,信息工程学院教师余振华博士在单细胞测序数据生成方面取得重要进展,其论文《SCSsim: an integrated tool for simulating single-cell genome sequencing data》(单细胞测序数据集成仿真)被生物信息学领域国际顶级期刊Bioinformatics接收发表,DOI:https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz713.该期刊同时被SCI和EI检索,中科院JCR大类二区、小类一区,2019年影响因子4.531,也是我校在生物信息学领域发表的期刊影响力较高的论文之一。

该研究成果主要针对等位基因脱扣、扩增不均衡等单细胞测序特有技术特性,通过模拟MALBAC单细胞基因组扩增过程,并采用统计建模方法挖掘测序数据分布特性,使得产生的单细胞测序数据与预期结果高度一致。该方法有效解决了单细胞测序数据的精准构建问题,弥补了当前批量数据模拟方法的短板。有效集成了单细胞测序数据生成的各个模块,使得在统一框架中可端到端模拟单细胞数据,极大简化了数据处理流程。项目中完成的工具包可供相关研究人员使用(https://github.com/qasimyu/scssim)。 

该成果主要合作老师包括中国科学技术大学信息学院李骜副教授以及宁夏大学信息工程学院杜方教授和孙学宏教授;并获得国家自然科学基金青年项目和面上项目的资助。

(责任编辑:胡玥)